在手術切除後，仍必須要定期做追蹤檢查，一般來說，前兩年必須要每三個月追蹤一次，第三年到第五年則可延長到半年追蹤一次，五年之後也應該每年定期追蹤一次。在密切的追蹤檢查中，腫瘤標記CEA對大腸直腸癌的復發偵測較具價值，可做為疾病的參考之一，但並不是唯一的依據。
另外，女性病人會比一般人有較高的機率得到
乳癌、
卵巢癌及
子宮頸癌，而男性病人罹患
攝護腺癌的機率也比一般人高，所以在追蹤的過程中，也需注意是否有罹患另一癌症的可能，以期早點發現並治療。
根據國內醫學中心的統計：第一期的結直腸癌病人五年存活率可高達
90%以上，而第二期約為
70%，第三期則為
50%，至於第四期的病人則預後較差。大部分的病人在接受手術治療後，若有
復發或轉移都發生於頭兩年內，超過五年之後復發的機會就減少很多。
| 一般建議追蹤的時程表 |
| 時間 |
治療前 |
三個月 |
六個月 |
九個月 |
一年 |
三個月 |
三個月 |
兩年 |
兩年半 |
三年 |
三年半 |
四年 |
四年半 |
五年 |
| 身體檢查 |
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| CEA |
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| 胸部X光 |
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| 電腦斷層 |
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| 腹部超音波 |
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| 大腸鏡 |
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| ※各醫院追蹤時程略有不同 |
